Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rdh11Q9QYF1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rdh11Q9QYF1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rdh11Q9QYF1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rdh11Q9QYF1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rdh11Q9QYF1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rdh11Q9QYF1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh11Q9QYF1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms