Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid2Q9QUS6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid2Q9QUS6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms