Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN5

Prl3c1, Prolactin-3C1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3c1Q9QUN5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prl3c1Q9QUN5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prl3c1Q9QUN5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prl3c1Q9QUN5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prl3c1Q9QUN5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prl3c1Q9QUN5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prl3c1Q9QUN5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prl3c1Q9QUN5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prl3c1Q9QUN5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms