Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms