Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms