Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cabp1Q9JLK7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms