Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SacsQ9JLC8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms