Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrac1Q9JKP8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms