Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms