Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pard6bQ9JK83 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms