Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms