Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms