Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim39Q9ESN2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim39Q9ESN2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim39Q9ESN2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim39Q9ESN2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim39Q9ESN2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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