Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn10Q9ESK3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn10Q9ESK3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms