Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snap29Q9ERB0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms