Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms