Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhojQ9ER71 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms