Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms