Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Barx1Q9ER42 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Barx1Q9ER42 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Barx1Q9ER42 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Barx1Q9ER42 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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