Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ndst3Q9EQH7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ndst3Q9EQH7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ndst3Q9EQH7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ndst3Q9EQH7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ndst3Q9EQH7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ndst3Q9EQH7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ndst3Q9EQH7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ndst3Q9EQH7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ndst3Q9EQH7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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