Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r46Q9EQ45 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r46Q9EQ45 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms