Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl4Q9DCU6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms