Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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