Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a3Q9DCP2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a3Q9DCP2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms