Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cpne8Q9DC53 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne8Q9DC53 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms