Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CrotQ9DC50 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrotQ9DC50 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms