Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx6Q9DBY5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx6Q9DBY5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms