Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Asf1bQ9DAP7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms