Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bpifa3Q9D9J8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bpifa3Q9D9J8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms