Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms