Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms