Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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