Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930513O06RikQ9D549 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930513O06RikQ9D549 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms