Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D4W2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D4W2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms