Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lonrf3Q9D4H7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms