Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms