Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933428M09RikQ9D3X3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms