Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D3J9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms