Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms