Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl28Q9D1B9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl28Q9D1B9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl28Q9D1B9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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