Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem53Q9D0Z3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem53Q9D0Z3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms