Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc7Q9D0M0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms