Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pbdc1Q9D0B6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms