Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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