Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shisa9Q9CZN4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms