Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajc18Q9CZJ9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dnajc18Q9CZJ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms