Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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