Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prdm5Q9CXE0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms