Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX80

Cygb, Cytoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CygbQ9CX80 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CygbQ9CX80 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CygbQ9CX80 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms