Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxxc1Q9CWW7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms